Prodotti

La fosforamidite 2'-F-dU (nota anche come fosforamidite DMT‑2′‑F‑dU, CAS 146954-75-8) è un monomero fosforamide deossiuridina chimicamente modificato caratterizzato da una sostituzione 2′‑fluoro (2′‑F) sullo zucchero desossiribosio, un gruppo protettivo 5′‑O‑dimetossitritile (DMT) e un β‑cianoetil (CE) fosforammidito nella posizione 3'. La base uridina è presente senza alcun gruppo protettivo amminico esociclico (a differenza della citidina o dell'adenosina), semplificando la sintesi e la deprotezione degli oligonucleotidi contenenti questa modifica. La modificazione 2′‑fluoro è una delle modifiche chimiche più potenti per migliorare la resistenza alle nucleasi e la stabilità termica nelle terapie oligonucleotidiche. L'atomo di fluoro altamente elettronegativo nella posizione 2′ blocca lo zucchero in una conformazione C3′‑endo (simile a RNA), che preorganizza la struttura oligonucleotidica per un legame stretto con target di RNA complementari. La fosforamidite 2'-F-dU è ampiamente utilizzata nella sintesi di siRNA, oligonucleotidi antisenso (ASO) e aptameri, in particolare dove è necessaria una base simile alla timina ma con una maggiore affinità di legame per l'adenosina.

L'1,2-dioleoil-3-trimetilammonio-propano (sale cloruro), comunemente indicato come cloruro DOTAP, è un lipide cationico ampiamente riconosciuto per il suo ruolo nel rilascio dell'acido nucleico. Strutturalmente, la molecola presenta una testata di ammonio quaternario che trasporta una carica positiva permanente, due catene oleoiliche da 18 carbonio (C18:1) ciascuna contenente un doppio legame cis e un controione cloruro che bilancia la carica complessiva. Le code degli acidi grassi insaturi introducono nodi nelle catene aciliche, aumentando la fluidità della membrana e promuovendo la fusione liposomiale con le membrane cellulari. La forma di sale cloruro dell'1,2-dioleoil-3-trimetilammonio-propano (sale cloruro) è la formulazione preferita per applicazioni biologiche, poiché il controione cloruro garantisce solubilità acquosa e compatibilità con le condizioni fisiologiche, a differenza delle forme di sale ioduro scarsamente solubili. Questa combinazione di carica cationica permanente e code insature flessibili rende l'1,2-dioleoil-3-trimetilammonio-propano (sale cloruro) un elemento costitutivo eccezionalmente efficace per la formulazione di liposomi e nanoparticelle lipidiche (LNP) per applicazioni di trasferimento genico.

Bz-rC Phosphoramidite (noto anche come DMT‑2′‑O‑TBDMS‑rC(Bz) Phosphoramidite, CAS 118380-84-0) è un monomero ribonucleosidico fosforammiditico standard utilizzato nella sintesi dell'RNA in fase solida. La molecola presenta un gruppo protettivo 2′-O‑TBDMS (tert‑butildimetilsilile) sullo zucchero ribosio, un gruppo protettivo dell'ammina esociclica N4‑benzoile (Bz) sulla base della citosina, un gruppo protettivo 5'-O‑dimetossitritile (DMT) nella posizione 5'-idrossile e una funzionalità β‑cianoetil (CE) fosforamidite nella posizione 3'. Il gruppo N4‑benzoile è una delle strategie di protezione più utilizzate per l'ammina esociclica della citosina, poiché fornisce una solida protezione contro l'acilazione indesiderata e le reazioni di ramificazione durante l'assemblaggio della catena oligonucleotidica. Il gruppo 2′-O‑TBDMS è il classico gruppo protettivo del 2′-idrossile nella sintesi dell'RNA, offrendo un'eccellente selettività durante la deprotezione e compatibilità con i cicli di sintesi standard in fase solida. La fosforamidite Bz-rC è l'elemento costitutivo preferito dai ricercatori che necessitano di incorporazione ad alta fedeltà di residui di citidina in oligonucleotidi di RNA sintetici per applicazioni che vanno dalla biologia strutturale alle terapie dell'RNA.

La 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidite (nota anche come DMT-2′-O-Methyl-rA(Bz) Phosphoramidite, CAS 110782-31-5) è un monomero di fosforamidite ribonucleosidico chimicamente modificato caratterizzato da una modifica 2′-O-metil sullo zucchero ribosio, un'ammina esociclica N6-benzoil (Bz) gruppo protettivo sulla base di adenina e un gruppo protettivo standard 5′-O-dimetossitritile (DMT) in posizione 5′-idrossile, con una funzionalità fosforamide β-cianoetil (CE) in posizione 3′. La modifica 2'-O-metile è una delle modifiche dello zucchero più ampiamente caratterizzate e ampiamente adottate nella chimica degli oligonucleotidi; questa sostituzione aumenta la stabilità termica dei duplex formati con filamenti di RNA complementari e conferisce una resistenza significativa alla degradazione mediata dalle nucleasi senza alterare le proprietà di accoppiamento delle basi Watson-Crick. L'impalcatura rigida di adenosina biciclica, combinata con il gruppo metossi in posizione 2′, blocca lo zucchero in una conformazione C3′-endo (simile a RNA), che pre-organizza la struttura oligonucleotidica per un'ibridazione ottimale verso sequenze di RNA bersaglio. Il gruppo protettivo benzoile nella posizione N6 della base adenina fornisce una solida protezione durante la sintesi oligonucleotidica in fase solida contro reazioni collaterali indesiderate, mentre il gruppo 5′-O-DMT consente una facile purificazione mediante cromatografia in fase inversa o cartucce tritil-on. La fosforamidite 2′-O-metil-rA (N-Bz) è quindi l'elemento costitutivo preferito dai ricercatori che cercano di introdurre modifiche sito-specifiche della 2′-O-metiladenosina in RNA, siRNA, oligonucleotidi antisenso (ASO), aptameri e altre sostanze terapeutiche a base di acidi nucleici modificate chimicamente.

Il prodotto è 2'-OMe-U fosforamidite (5'-O-(4,4'-dimetossitritil)-2'-O-metil-uridina-3'-O-[(2-cianoetil)-(N,N-diisopropil)]-fosforamidite). È un fosforamidite di RNA modificato in cui un gruppo metilico sostituisce l'idrogeno sul 2'-idrossile dello zucchero uridina ribosio. Questa modifica apparentemente minore del 2'-O-metil (2'-OMe) altera drasticamente le proprietà del nucleotide: aumenta la resistenza dell'oligonucleotide alla degradazione della nucleasi, riduce la stimolazione immunitaria e migliora l'affinità di legame con l'RNA complementare. La fosforamidite 2'-OMe-U è il reagente standard per introdurre questa modificazione benefica nelle sequenze di RNA durante la sintesi in fase solida.

Il 5'-O-(4,4'-DiMetossitritil)-N4-benzoil-2'-deossi-5-metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilMino) fosforamide (comunemente abbreviato come DMT‑dC(Bz,5‑Me) fosforamidite, CAS 105931-57-5) è un monomero di deossiribonucleoside fosforammidito modificato caratterizzato da una base 5‑metilcitosina con un gruppo protettivo N4‑benzoile, uno zucchero 2′‑desossiribosio, un gruppo protettivo 5′‑O‑dimetossitritile (DMT) e un β‑cianoetil fosforammidito in posizione 3′. La modificazione della 5‑metilcitosina si verifica naturalmente nel DNA come marcatore epigenetico (metilazione CpG) ed è anche ampiamente utilizzata nella chimica degli oligonucleotidi antisenso (ASO) per migliorare la resistenza alle nucleasi e modulare l'affinità di legame. Quando incorporata negli oligonucleotidi, la base 5‑metilcitosina si accoppia con la guanina nella geometria standard Watson-Crick ma non è riconosciuta come substrato per alcune DNA metiltransferasi, a seconda del contesto della sequenza. Il 5'-O-(4,4'-DiMetossitritil)-N4-benzoil-2'-deossi-5-metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilMino) fosforamidito è un elemento fondamentale per la sintesi di oligonucleotidi contenenti CpG con pattern di metilazione definiti, nonché per i farmaci antisenso in cui il Il gruppo 5-metile riduce l'immunostimolazione e aumenta la stabilità termica duplex.