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Fmoc-Asn-OH (CAS 71989-16-7), noto anche come Nα-Fmoc-L-asparagina, è un elemento fondamentale di amminoacidi protetti da Nα-Fmoc per l'introduzione di residui di asparagina nella sintesi peptidica in fase solida basata su Fmoc (SPPS). La molecola è costituita dall'amminoacido L-asparagina con la sua posizione Nα protetta dal gruppo 9-fluorenilmetilossicarbonile (Fmoc) base labile, mentre la catena laterale carbossammide rimane non protetta.

Fmoc-Arg(Pmc)-OH (CAS 119831-72-0) è un derivato dell'arginina premium protetto da Nα-Fmoc caratterizzato dal gruppo protettivo Pmc (2,2,5,7,8-pentametilcroman-6-solfonile) sulla catena laterale del guanidinio. La molecola combina il gruppo 9-fluorenilmetilossicarbonile (Fmoc) labile alle basi per una protezione temporanea Nα durante l'assemblaggio della catena peptidica con il gruppo Pmc labile agli acidi che salvaguarda la funzionalità altamente reattiva del guanidinio dell'arginina.

Fmoc-N-Me-Arg(Pbf)-OH (CAS 913733-27-4) è un derivato specializzato dell'arginina Nα-metilato protetto da Nα-Fmoc con il gruppo protettivo Pbf (2,2,4,6,7-pentametildiidrobenzofuran-5-solfonile) labile agli acidi sulla catena laterale del guanidinio. La molecola incorpora tre elementi strutturali chiave: il gruppo 9-fluorenilmetilossicarbonile (Fmoc) base-labile per la protezione temporanea Nα durante l'assemblaggio della catena peptidica, la Nα-metilazione che introduce vincoli conformazionali e migliora la stabilità metabolica nelle terapie peptidiche, e il gruppo guanidinio protetto da Pbf sulla catena laterale dell'arginina che previene reazioni collaterali indesiderate durante l'accoppiamento.

Fmoc-Tyr(Me)-OH (Nα-[(9H-fluoren-9-ilmetossi)carbonil]-O-metil-L-tirosina, noto anche come Fmoc-4-metossi-L-fenilalanina) è un derivato della tirosina protetto da Fmoc caratterizzato da un gruppo protettivo di etere metilico sulla catena laterale dell'idrossile fenolico. Il fenolo della catena laterale della tirosina viene metilato per formare un residuo stabile di 4-metossifenilalanina, un amminoacido non canonico che funge da surrogato della tirosina nella ricerca sui peptidi.

Fmoc-Tyr(tBu)-OH (Nα-[(9H-fluoren-9-ilmetossi)carbonil]-O-tert-butil-L-tirosina) è un derivato tirosinico protetto da Fmoc caratterizzato da un gruppo protettivo etere tert-butil (tBu) sulla catena laterale dell'idrossile fenolico. La catena laterale della tirosina – un anello fenolico con un gruppo ossidrile libero – è suscettibile a reazioni collaterali indesiderate durante la sintesi peptidica, tra cui acilazione, ossidazione e formazione di sottoprodotti O-acilati.

Fmoc-His(Boc)-OH (Nα-[(9H-fluoren-9-ilmetossi)carbonil]-Nτ-tert-butossicarbonil-L-istidina) è un derivato dell'istidina doppiamente protetto caratterizzato dal gruppo Fmoc (9-fluorenilmetossicarbonile) base labile nella posizione α-amminica e dal gruppo Boc (terz-butossicarbonile) labile agli acidi sull'imidazolo azoto Nτ della catena laterale. Questa strategia di protezione ortogonale – Fmoc rimovibile in condizioni basiche blande e Boc scisso in condizioni acide – consente una deprotezione precisa e sequenziale durante la sintesi peptidica in fase solida (SPPS).