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H-D-Lys(Boc)-NH2 (N⁶-(terz-butossicarbonil)-D-lisina ammide) è un derivato della D-lisina a enantiomero singolo, protetto ortogonalmente. Con la formula molecolare C₁₁H₂₃N₃O₃ e un peso molecolare di 245,32 g/mol, questo composto presenta un'architettura molecolare costituita da un gruppo α-amminico libero, una carbossammide C-terminale e una catena laterale ε-amminica protetta da tert-butossicarbonile (Boc).

Boc-Pip-OtBu (tert-butil 4-{[(tert-butossi)carbonil]ammino}piperidina-4-carbossilato) è un derivato piperidinico protetto con doppi gruppi protettivi tert-butile. Con la formula molecolare C₁₅H₂₈N₂O₄ e un peso molecolare di 300,39 g/mol, questo composto presenta un anello piperidinico con entrambe le funzionalità amminica e carbossilica protette rispettivamente come terz-butil carbammati e tert-butile esteri.

Boc-Alaninolo (N-Boc-(S)-2-amminopropanolo) è un amminoalcol chirale derivato dalla L-alanina, caratterizzato da un gruppo protettivo tert-butilossicarbonile (Boc) sull'ammina e un gruppo ossidrile primario libero. La molecola, con formula molecolare C₈H₁₇NO₃ e peso molecolare di 175,23 g/mol, presenta una configurazione (S) ben definita nello stereocentro adiacente all'ammina, rendendola un elemento costitutivo chirale enantiopuro.

Boc-Pro-NH₂ (N-(tert-butossicarbonil)-L-prolinamide, CAS 35150-07-3) è un derivato protetto da Boc della L-prolina caratterizzato da un'ammide primaria in posizione C2. La molecola è costituita da un anello pirrolidinico con un gruppo tert-butilossicarbonile (Boc) che protegge l'azoto dell'anello e un gruppo carbossammide (-CONH₂) nello stereocentro C2.

Fmoc-Lys(C16-OtBu)-OH (CAS 2952671-06-4) è un derivato della lisina specializzato protetto da Fmoc caratterizzato da una porzione lipidica C16 a catena lunga (gruppo esadecanoile/palmitoile) attaccata al gruppo ε-amminico della lisina tramite un legame ammidico, con l'acido carbossilico C-terminale protetto come tert-butile estere. Questa architettura molecolare unica combina la funzionalità α-amminica protetta da Fmoc richiesta per la sintesi peptidica in fase solida con una catena alchilica lipofila C16 che conferisce proprietà anfifiliche ai peptidi risultanti.

Fmoc-D-Trp-OH (Nα-Fmoc-D-triptofano, CAS 86123-11-7) è un derivato protetto da Fmoc dell'enantiomero D del triptofano, un amminoacido aromatico essenziale. La molecola presenta il gruppo 9-fluorenilmetossicarbonile (Fmoc) che protegge la funzione α-amminica, mentre l'acido carbossilico rimane libero per l'allungamento della catena peptidica. La catena laterale indolica di Fmoc-D-Trp-OH fornisce sia carattere aromatico che capacità di legame idrogeno, rendendo questo composto un prezioso elemento costitutivo per incorporare residui di D-triptofano in sequenze peptidiche tramite sintesi peptidica in fase solida Fmoc (SPPS).