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Z-Trp(Boc)-OH.DCHA (sale di Nα-Z-Nᶦⁿ-Boc-L-triptofano dicicloesilammonio) è un derivato dell'L-triptofano doppiamente protetto con due gruppi protettivi ortogonali. La molecola è costituita da un nucleo di L-triptofano con un gruppo carbobenzossi (Z) che protegge la funzionalità α-amminica e un gruppo tert-butilossicarbonile (Boc) che protegge l'azoto della catena laterale dell'indolo.

Boc-D-Phe-OH (N-α-terz-Butossicarbonil-D-fenilalanina) è un derivato protetto della D-fenilalanina caratterizzato da un gruppo terz-butilossicarbonile (Boc) attaccato alla funzionalità α-ammino. La molecola è costituita da un nucleo di fenilalanina con configurazione D – un amminoacido chirale con una catena laterale benzilica – con il gruppo protettivo Boc che protegge il gruppo amminico da reazioni collaterali indesiderate.

GS-650804 / Boc-(S)-ciclopropilglicina (acido N-[(1,1-dimetiletossi)carbonil]-(S)-ammino-ciclopropilacetico) è un amminoacido non naturale protetto da Boc caratterizzato da un gruppo ciclopropilico sul carbonio α dello scaffold della glicina. Questo motivo strutturale unico combina l'anello ciclopropilico stericamente vincolato con la chiralità della configurazione (S), creando un analogo amminoacidico conformazionalmente bloccato che è molto apprezzato nella chimica medicinale e nella ricerca sui peptidi.

Boc-His(Trt)-Ala-OH (N-[(1,1-dimetiletossi)carbonil]-1-(trifenilmetil)-L-istidil-L-alanina) è un elemento costitutivo dipeptidico protetto caratterizzato da un residuo di istidina protetto da Boc all'estremità N con un gruppo tritile (Trt) sulla catena laterale dell'imidazolo, accoppiato a un residuo di alanina all'estremità C.

Pal-Lys(Boc)-OH (N-[(1,1-dimetiletossi)carbonil]-L-lisina palmitoil estere) è un derivato amminoacidico specializzato caratterizzato da uno scheletro di lisina con doppie modifiche: un gruppo protettivo tert-butilossicarbonile (Boc) sulla funzionalità α-amminica e un gruppo estere palmitoil (esadecanoil) sul carbossile della catena laterale.

H-D-Lys(Boc)-NH2 (N⁶-(terz-butossicarbonil)-D-lisina ammide) è un derivato della D-lisina a enantiomero singolo, protetto ortogonalmente. Con la formula molecolare C₁₁H₂₃N₃O₃ e un peso molecolare di 245,32 g/mol, questo composto presenta un'architettura molecolare costituita da un gruppo α-amminico libero, una carbossammide C-terminale e una catena laterale ε-amminica protetta da tert-butossicarbonile (Boc).