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Boc-D-Phe-Pro-Arg-Pro-OH.HCl è un tetrapeptide protetto costituito da quattro residui amminoacidici nella sequenza D-Phe-Pro-Arg-Pro, con un gruppo protettivo tert-butilossicarbonile (Boc) all'N-terminale e al C-terminale come acido carbossilico libero, stabilizzato come sale cloridrato.

H-D-Lys(Boc)-OtBu.HCl è un derivato della D-lisina protetto ortogonalmente caratterizzato da un gruppo α-amminico libero stabilizzato come sale cloridrato, un gruppo protettivo terz-butilossicarbonile (Boc) sulla catena laterale ε-ammino e un estere terz-butilico (OtBu) all'estremità C-terminale.

Boc-Lys(Boc)-ONp (Nα,ε-di-Boc-L-lisina 4-nitrofenil estere) è un derivato della lisina doppiamente protetto con gruppi protettivi Boc su entrambi i gruppi α-ammino e ε-ammino, con un estere 4-nitrofenil (ONp) che attiva il C-terminale. 

H-N-Me-Trp(Boc)-OAll Oxalate (tert-butil (S)-3-(3-(allilossi)-2-(metilammino)-3-ossopropil)-1H-indolo-1-carbossilato ossalato) è un derivato specializzato del triptofano N-metilato dotato di protezione ortogonale dei suoi tre gruppi funzionali. La molecola incorpora un gruppo Nα-metilico (H-N-Me), un azoto indolico protetto da Boc e un gruppo protettivo estere allilico (OAll) al C-terminale.

Boc-Val-OH (N-(tert-Butossicarbonil)-L-valina) è un derivato protetto da Boc dell'amminoacido essenziale a catena ramificata L-valina. La molecola è costituita da un nucleo di valina con il suo gruppo α-amminico protetto da un gruppo terz-butossicarbonile (Boc), mentre l'acido carbossilico rimane libero per le reazioni di accoppiamento. Questa strategia di protezione rende il gruppo amminico inerte in condizioni basiche e nucleofile mentre consente la deprotezione selettiva in condizioni acide (tipicamente TFA).

Boc-Arg-OH·H₂O·HCl (Nα-(tert-butossicarbonil)-L-arginina cloridrato monoidrato) è un derivato protetto dell'arginina caratterizzato da un gruppo tert-butossicarbonile (Boc) che protegge il gruppo α-ammino, presentato come sale cloridrato monoidrato. La molecola è costituita da uno scheletro di L-arginina con il gruppo α-amminico mascherato dal carbammato Boc, la catena laterale del guanidinio intatta e l'acido carbossilico presentato come acido libero.